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ATOM国民保養温泉とは、温泉法に基づき、「温泉の公共的利用増進のため、温泉利用施設の整備及び環境の改善に必要な地域」として環境大臣が指定した温泉地のことをいいます。
温泉の湧出量が豊富であること、効能が顕著であること、付近の景観が優れていること等が指定の要件とされ、温泉利用を中心とした健全な保養地としておおいに活用されることが期待されています。
北海道では下記の温泉が、国民保養温泉に指定されています。
| 温泉名 | 所在地 |
| カルルス温泉 | 登別市 |
| 北湯沢温泉 | 伊達市 |
| 【ニセコ温泉郷】 ワイス高原温泉 | 虻田郡倶知安町 |
| 【ニセコ温泉郷】 ひらふ温泉 | 虻田郡倶知安町 |
| 【ニセコ温泉郷】 五色温泉 | 虻田郡ニセコ町 |
| 【ニセコ温泉郷】 湯本温泉 | 磯谷郡蘭越町 |
| 【ニセコ温泉郷】 東山温泉 | 虻田郡ニセコ町 |
| 【ニセコ温泉郷】 昆布温泉 | 虻田郡ニセコ町･磯谷郡蘭越町 |
| 【ニセコ温泉郷】 湯の里温泉 | 磯谷郡蘭越町 |
| 【ニセコ温泉郷】 薬師温泉 | 磯谷郡蘭越町 |
| 【ニセコ温泉郷】 新見温泉 | 磯谷郡蘭越町 |
| 【ニセコ温泉郷】 アンヌプリ温泉 | 虻田郡ニセコ町 |
| 【ニセコ温泉郷】 駅前温泉 | 虻田郡ニセコ町 |
| 【ニセコ温泉郷】 昆布川温泉 | 磯谷郡蘭越町 |
| 【恵山温泉郷】 恵山温泉 | 函館市 |
| 【恵山温泉郷】 水無海浜温泉 | 函館市 |
| 十勝岳温泉郷 | 空知郡上富良野町 |
| 然別峡温泉（菅野温泉） | 河東郡鹿追町 |
| 芦別温泉 | 芦別市 |
| 雌阿寒温泉（野中温泉） | 足寄郡足寄町 |
| 湯ノ岱温泉 | 桧山郡上ノ国町 |
| 盃温泉 | 古宇郡泊村 |
| 貝取澗温泉 | 遠郡せたな町 |
| 幕別温泉 | 中川郡幕別町 |
| ながぬま温泉 | 夕張郡長沼町 |
| 豊富温泉 | 天塩郡豊富町 |
| 洞爺・陽だまり温泉（洞爺温泉） | 虻田郡洞爺湖町 |
